Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms