Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rnf17Q99MV7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf17Q99MV7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms