Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tm2d1Q99MB3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms