Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dok4Q99KE3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms