Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Spef1Q99JL1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spef1Q99JL1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms