Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Def8Q99J78 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms