Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms