Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Afg3l1Q920A7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms