Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms