Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms