Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms