Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc2Q8VI47 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms