Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms