Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms