Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Dnajc28Q8VCE1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms