Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BbxQ8VBW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BbxQ8VBW5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms