Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nup58Q8R332 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms