Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms