Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms