Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ssh3Q8K330 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssh3Q8K330 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ssh3Q8K330 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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