Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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