Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacs1Q8K212 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pacs1Q8K212 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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