Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf208Q8K0W3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf208Q8K0W3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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