Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d5Q8JZW5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms