Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TwnkQ8CIW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwnkQ8CIW5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms