Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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