Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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