Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg4aQ8C9S8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Atg4aQ8C9S8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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