Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dclre1bQ8C7W7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dclre1bQ8C7W7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dclre1bQ8C7W7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dclre1bQ8C7W7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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