Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8C5C9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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