Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdac7Q8C2B3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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