Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms