Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms