Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc2Q8BZW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms