Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms