Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp38Q8BW70 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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