Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp398Q8BV16 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms