Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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