Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a4Q8BUE1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms