Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BPC6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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