Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q8BP99 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q8BP99 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q8BP99 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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