Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nop53Q8BK35 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nop53Q8BK35 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop53Q8BK35 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nop53Q8BK35 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop53Q8BK35 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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