Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc40Q8BI79 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc40Q8BI79 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms