Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms