Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms