Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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