Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms