Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubp1Q811S7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubp1Q811S7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubp1Q811S7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubp1Q811S7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubp1Q811S7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubp1Q811S7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ubp1Q811S7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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