Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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