Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChfrQ810L3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ChfrQ810L3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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